新鲜的香菇可以用干净的抹布擦拭干净，放入塑料袋中保存。将香菇的伞朝向袋子底部，鲜香菇的柄朝向袋口，整齐存放好后封好袋口，在袋子上扎几个孔，这样可以存放两三周。
如果只是保存几天，这个时候可以存放在干燥、通风的地方保存。
香菇也可以存放在冰箱中保存，鲜香菇内含水分比较多，不能冷冻。冷藏的话du要放入保鲜盒，然后在2-4℃保存。
储存香菇的时候，一定要避光储存，必须避免在强光下储存，同时还要避免用透光的材料包装，可以用铁罐、陶瓷缸等可密封的容器装贮香菇，容器应内衬食品袋。要尽量少开容器口，这样可以延长香菇的保质期。
香菇吸水性比较强，这种食物不是很好储存，如果含水量比较高的时候，很容易发生变质，所以这种食物最好是干燥后才能进行贮存。贮存容器内必须放入适量的块状石灰或干木炭等吸湿剂，这样可以防止返潮。