普通本科和应用本科是本科教育的两种类型，它们的关系应是平行发展的。应用本科是高职教育的一个层次，它同一般普通本科相比具有鲜明的技术应用性特征。在培养规格上，应用本科培养的不是学科型、学术型、研究型人才，而是培养适应生产、建设、管理、服务第一线需要的高等技术应用性人才;在培养模式上，应用本科以适应社会需要为目标。
应用型本科和普通本科的区别如下：
1、出发点不同
普通本科：以科研教学为重，实际操作为辅，多以综合类大学为主，注重学生在学术上的能力，知识更多的是限于书本上的理论。
应用型本科：结合中国现在的经济社会发展，以实际操作为重，理论知识为辅，多以工科类大学为主，注重学生在单一技术上的能力，知识更多的是限于实际操作上的技术。
2、各领域不同
普通本科：相对发展领域较宽，拓展范围广，但学校专注的学科并不多，对单一学科进行学术研究，并进行报告论文书写，以提升学校在全国乃至世界的影响力。
应用型本科：开设的专业并不多，对单一工科类专业的研究和探讨，对专业进行技术上的学习，并进行设计方案书写，以提升学校专业技术能力上的水准。
3、招收不同
普通本科：主要招收高中毕业生，学制依据不同专业，一般为4-5年，少量招收专科毕业生，学制两年。
应用型本科：主要招收高中毕业生，由部分省属本科院校与国家级示范性高等职业院校、国家大型骨干企业联合试点培养适应社会经济发展需求的应用型本科人才。